Подпрограмма 1. Расширение мощностей электрогенерации атомных электростанций на территории Российской Федерации
Подпрограмма 2. Обеспечение безопасного обращения с федеральными радиоактивными отходами, поддержание в безопасном состоянии и утилизация ядерно и радиационно опасных объектов ядерного наследия (открытая часть)
Подпрограмма 3. Реализация международных проектов в области использования атомной энергии и участие в деятельности международных организаций
Подпрограмма 4. Обеспечение исполнения Государственной корпорацией по атомной энергии "Росатом" государственных полномочий и функций в установленной сфере деятельности
Подпрограмма 5. Обеспечение производственных, технологических и социально-экономических процессов устойчивого развития ядерного оружейного комплекса Российской Федерации и стратегического присутствия России в Арктической зоне» (несекретная часть)
Подпрограмма 6. Разработка технологий двухкомпонентной атомной энергетики с замкнутым ядерным топливным циклом
Подпрограмма 7. Разработка новых материалов и технологий для перспективных энергетических систем
Подпрограмма 9. Разработка новых материалов и технологий для перспективных энергетических систем